Для управления iptables в debian 7, 8 удобно использовать netfilter-persistent (iptables-persistent).

1
2
3
apt-get update
apt-get install netfilter-persistent chkconfig
chkconfig netfilter-persistent on

Управление производится простыми командами

1
2
3
4
invoke-rc.d netfilter-persistent {flush, force-reload, reload, restart, save, start}
flush - очистить правила
reload - загрузить из файлов
save - сохранить в файлы

Правила хранятся в файлах

1
2
/etc/iptables/rules.v4 
/etc/iptables/rules.v6

Соответственно для IPv4 и IPv6. В ранних версиях debian этот пакет назывался iptables-persistent.