Установка ionCube PHP loader достаточно проста, для этого вам необходимо скачать данный модуль соответствующий архитектуре Вашей ОС с сайта разработчика IonCube.
Пример представлен по установке IonCube Loader на Debian 6.0 x86_64:

Скачиваем архив с сайта разработчика следующей командой:

1

wget http://downloads2.ioncube.com/loader_downloads/ioncube_loaders_lin_x86-64.tar.gz

Распаковываем архив выполнив команду:

1

tar -xvf ioncube_loaders_lin_x86-64.tar.gz

Смотрим версию PHP командой:

1
2
3
4

#php -v
PHP 5.3.3-7+squeeze3 with Suhosin-Patch (cli) (built: Jun 28 2011 08:24:40) 
Copyright (c) 1997-2009 The PHP Group
Zend Engine v2.3.0, Copyright (c) 1998-2010 Zend Technologies

Копируем модули соответствующие версии PHP на сервере в директорию с модулями php или создаем отдельную директорию ioncube/ и копируем в нее (в данном случае мы создали отдельную директорию для модуля), следующей командой:

1
2

cp ioncube/ioncube_loader_lin_5.3.so /usr/lib/php5/ioncube/
cp ioncube/ioncube_loader_lin_5.3_ts.so /usr/lib/php5/ioncube/

Добавляем в файл php.ini или создаем отдельный файл ioncube.ini, в данном примере создаем отдельный файл в /etc/php5/conf.d/ioncube.ini и добавляем следующие строки:
#vi /etc/php5/conf.d/ioncube.ini

1
2

zend_extension = /usr/lib/php5/ioncube/ioncube_loader_lin_5.3.so
zend_extension_ts = /usr/lib/php5/ioncube/ioncube_loader_lin_5.3_ts.so

Cохраняем изменения в файле и перезагружаем web-сервер Apache:
#/etc/init.d/apache2 restart

Проверяем результат установки модуля:
#php -m

1
2
3

[Zend Modules]
Zend Guard Loader
the ionCube PHP Loader

или

1
2
3
4
5
6
7

#php -v
PHP 5.3.3-7+squeeze3 with Suhosin-Patch (cli) (built: Jun 28 2011 08:24:40) 
Copyright (c) 1997-2009 The PHP Group
Zend Engine v2.3.0, Copyright (c) 1998-2010 Zend Technologies
    with the ionCube PHP Loader v4.2.0, Copyright (c) 2002-2012, by ionCube Ltd., and
    with Zend Guard Loader v3.3, Copyright (c) 1998-2010, by Zend Technologies
    with Suhosin v0.9.32.1, Copyright (c) 2007-2010, by SektionEins GmbH